Hej 
to zależy co chcesz zrobić, zrestartować sam serwer (proces) Home Assistant czy całą bramkę
Opcja “Kontrola serwera” / “Uruchom ponownie i zatrzymaj serwer Asystent domowy” to restart samej usługi Home Assistant
To samo uzyskasz pisząc w konsoli:
pm2 restart ais
opcja “Wyłączenie bramki” to zatrzymanie wszystkich usług (ha, tunel, mqtt, ftp, ssh, zigbee …) , zatrzymanie systemu i ponowne uruchomienie
To samo uzyskasz pisząc w konsoli:
su -c reboot
a wyłączenie całkowite to
su -c reboot -p
Jeżeli zmieniasz cos w konfiguracji HA i to jest powodem restartu, to wystarczy restart serwera HA. W tym czasie mqtt i zigbee dalej działają (nie tracą połączenia z urządzeniami) w domu.
AIS to nie jest czysty HA, na “dzień dobry” działają komendy głosowe, treści audio i sporo innych integracji - wkładasz dongla zigbee, Jolka go rozpoznaje i uruchamia serwis 
Bramka ma działać i sterować domem - z przerwami (docelowo max raz w miesiącu) na aktualizację, nie ma potrzeby jej uruchamiać co chwilę.
Oczywiście każdy ma własne priorytety i ekonomie. Kolega ostatnio kupił komputer stacjonarny za 6 tysięcy złotych, bo kompilacja programu na laptopie zajmowała za dużo czasu.
Teraz kopiuje 10 minut szybciej, jak kompiluje to wentylator trochę w biurze hałasuje.
Kolega jest szczęśliwy, bo kompiluje się szybciej i to jest najważniejsze
Miłego weekendu @badzio